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食品微生物及生物技术
（1）酶工程技术及其在农产品加工中的应用
尤其是提高低值农产品附加值方面将有创新，"十五"期间可能筛选出原果胶酶、羧肽酶、α－淀粉酶高产菌株、脂肪酶高产菌株等达5株；原果胶酶将在果蔬加工废弃物的综合利用和羧肽酶在大豆多肽的脱苦方面以及原果胶酶基因在毕赤氏酵母中的克隆与表达将有较大的进展。
（2）微生物菌株（尤其是乳酸菌菌株）的分子生物学鉴定
PCR/RECP检测体系将在一定范围内应用，并与随机扩增多态性DNA技术结合，有望建立新型菌株鉴定体系。
（3）发酵大豆食品
液态发酵技术、纳豆激酶的提取纯化技术及其功能性研究方面将有新的进展，有望开发出中国风味的功能纳豆食品及达到药字号水准的溶栓酶产品；有望在大豆异黄酮的功能活性和组分、结构的关系研究、高出率、高纯度的提取纯化技术上有新的突破。
（4）超高压技术研究和应用
有望率先推出中国超高压食品如超高压豆奶及果蔬汁等，并在超高压技术的机理、应用及其杀菌模型建立方面均有重大突破。
（5）净菜流通体系的质量保证
有望在微生物模型建立及控制方面建立国内领先的技术体系，并在相关的包装、设备研发等方面有新的突破。
（6）新型微生物发酵剂的研制与开发
有望在高密培养技术上有重大突破，获得适于规模化生产的直投式发酵剂。
（7）在农产品深加工的HACCP、GMP体系建立方面，将达到与国际接轨的高水准。
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