动物医学院学科建设有了长足发展，为国务院学位委员会兽医学科评议组召集人单位，为全国兽医专业学位教育指导委员会秘书处挂靠单位，1995年设立兽医学博士后流动站，1997年学科调整前有4个博士点和10个硕士点，1998年获得兽医一级学科博士学位授予权，含基础兽医学、预防兽医学和临床兽医学三个博士学位授予点和三个硕士学位授予点，预防兽医学为国家级重点学科，基础兽医学为省级重点学科，临床兽医学为校级重点学科；有动物疫病诊断与免疫和动物生理生化两个农业部重点开放实验室和农业部动物疫病防治技术创新中心；并有4个校级研究室和3个校级工程技术中心。2003年动物医学专业被评为江苏省品牌专业建设点。“动物健康与卫生”为“211工程”建设项目。

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