前沿| 信息管理学院黄水清教授团队研制完成后生动物基因表达和可变剪接分析平台
近日,信息管理学院黄水清教授课题组研制完成后生动物基因表达和可变剪接数据分析平台(https://bioinfo.njau.edu.cn/metaExp),成果“MetazExp:adatabaseforgeneexpressionandalternativesplicingprofilesandtheiranalysesbasedon53615publicRNA-seqsamplesin72metazoanspecies”在生物信息学领域权威期刊NucleicAcidsResearch(IF=16.9)在线发表。高通量RNA-seq测序技术广泛应用于生物学研究,产生了海量转录组测序数据。重分析、共分析来自不同课题产生的原始数据可获得更多生物学假设。然而,复杂的数据处理要求和巨大的数据规模加剧了数据利用难度,造成海量数据难于重利用的尴尬局面。为消除生物学研究人员和大数据之间的沟渠,提升公共数据的利用率,该团队将情报学的数据采集、信息组织、领域知识挖掘方法应用于生物信息领域。以72种后生动物为对象,全面搜集整理了对应的53615个测序数据,对样品品系、基因型、组织、发育阶段、处理条件等重